Я сам редко сталкивался с такой ситуацией, но для больших проектов это наверняка часто встречающаяся проблема. Предположим, что скрипт выполняет какие-то запросы в базе данных (удление/добавления/редактирование) и во время этого пользователь нажимает кнопку Stop в браузере. По этой команде php скрипт завершает свою работу, что, в нашем случае может оказаться чреватым нарушением целостности базы данных.

Эта проблема решается функцией ignore_user_abort():
ignore_user_abort(true);

<!-- Ваши запросы к базе данных -->

ignore_user_abort(false);